学院拥有山东省环境过程与健康危害重点实验室、山东省水环境污染控制与资源化重点实验室、教育部南水北调东线河湖生态健康野外科学观测研究站、山东省水污染控制工程技术研究中心、山东省环境科学工程技术研究中心山东省中美环境与健康技术合作研究中心等6个省部级科研平台。2022 年新获批“山东省海洋生态环境实验室”和“青岛市海洋污染物防治重点实验室”。